对涡虫组织样本进行翻译组测序分析(WLU-FW-KS-NM-2025-0337)采购公告
正文内容
项目名称* 对涡虫组织样本进行翻译组测序分析 项目编号 WLU-FW-KS-NM-****-**** 公示开始日期 ****-**-** **:**:** 公示截止日期 ****-**-** **:**:** 采购单位 **大学 付款方式 内贸部分:货到验收合格后付全款 联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看 到货时间要求 预算总价 ¥***,*** 收货地址 供应商资质要求 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 ; 法定代表人资格证明书 (联系人须与法定代表人一致)/投标授权委托书(联系人须与被授权人一致) (必选) ; 被授权人社保缴纳证明 (近*个月) (必选) 采购清单* 采购物品 采购数量 计量单位 所属分类 对涡虫组织样本进行翻译组测序分析 * 项 品牌 规格型号 预算 ¥***,*** 技术参数 对涡虫组织样本进行翻译组测序分析:样品提取,质检,分离提取RPF,对RPF进行建库,文库质控,二代测序,对原始数据进行质控及分析。 *、质控指标 - RPFs长度分布,主峰应在**-** nt。 - rRNA残留率<**%,可通过比对参考基因组评估。 - 文库浓度≥** nM。 - 片段大小分布Agilent Bioanalyzer检测,主峰符合预期。 *. 测序要求 - 测序平台:Illumina NovaSeq。 - 读长:**-*** bp(覆盖RPFs及接头)。 - 数据量: ≥*** million reads/sample。 - 测序质量:Q** ≥ **%。 *. 数据分析与QC (*) 原始数据质控 - FastQC报告:评估测序质量、接头污染、GC含量等。 - 去接头与低质量过滤(使用Cutadapt/Trimmomatic)。 (*) 比对与特异性分析 - 比对参考基因组,使用STAR/HISAT*,提供比对率。 - rRNA/tRNA去除后比对率(目标mRNA占比应≥**%)。 - RPFs周期性分析。 (*) 高级分析(可选) - 翻译效率计算(RPFs vs RNA-seq)。 -差异翻译分析(如RiboDiff、Xtail)。 -新ORF预测(如uORFs、dORFs)。 -根据需求进行多组学关联分析,包括但不限于联合转录组测序、m*A-seq、蛋白组测序,ncRNA等 *. 交付要求 - 原始数据:FASTQ文件(含测序质量报告)。 - 质控报告:RPFs长度分布、rRNA残留率、比对统计、*-nt周期性图等。 - 分析结果: - 比对后的BAM文件。 - 标准化后的RPFs覆盖度文件(如WIG/BedGraph)。 - 差异翻译基因列表(如适用)。 *. 验收标准 - 实验阶段:RPFs长度符合预期,rRNA残留率达标。 - 测序阶段:数据量、Q**、比对率满足要求。 - 分析阶段:*-nt周期性显著,关键质控指标通过。 -完整的分析报告。 *. 交付期限: 承诺在样本检测合格后**个自然日内交付。 售后服务 **大学 ****-**-** **:**:**
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