武汉生物制品研究所有限责任公司NGS项目--招标公告

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国药中生武招字第（****）***号 *.目的 为保证高通量测序（NGS）平台运行，服务各科室，**公司拟采购高通量测序分析系统（转录组平台搭建、细菌/病毒基因组平台搭建、宏基因组数据平台搭建、宏基因组医学平台搭建）。通过本次招标选择一家符合资质、专业性强、有丰富高通量测序（NGS）平台经验的公司提供服务。 *.范围 高通量测序（NGS）分析系统包含：*、转录组平台搭建、细菌/病毒基因组平台搭建、宏基因组数据平台搭建、宏基因组医学平台搭建。*、对人员进行平台使用和生物信息学的培训。 *.投标单位资格 *.*投标单位必须在中国工商行政管理机关登记取得合格有效的营业执照，具有中华人民**国独立法人资格； *.*投标单位必须有相应高通量测序（NGS）相关资质，在行业主管部门备案且处于有效期内；投标单位的投标人非法人的，应出具本单位出具的法人代表授权委托书； *.*投标文件中必须有体现公司规模、人员配备及人员专业性的内容。 *.*投标单位应出具企业高通量测序（NGS）分析能力过往项目业绩证明，数量不少于*个（提供合同协议书）。 上述资料均需加盖公章，否则视为无效投标。 *.服务地点 ***郑店黄金工业园路*号**生物制品研究所有限责任公司。 *.服务时间 ****年*月*日-****年*月*日 *.工作内容及要求 投标方在投标前务必详细了解用户需求并到现场实地考察服务器，否则由此造成的一切后果均由投标方自行承担。 *.*工作内容 所购高通量测序（NGS）分析系统承担转录组平台、细菌/病毒基因组平台、宏基因组数据平台、宏基因组医学平台的搭建，为期不少于*年的免费售后服务（包括软件系统升级），期间提供甲方免费上门学习生物信息的知识，及对人员进行平台使用的培训。如果搭建的分析流程不能满足甲方分析的需求，乙方需每年提供不超过*次分析的服务。 *.*.*转录组平台搭建的内容 （*）样本的相关性分析 （*）样本的主成分分析 （*）差异基因筛选、差异基因箱图 （*）差异基因火山图 （*）差异基因的聚类热图 （*）差异基因韦恩图 （*）差异基因功能富集（GO和KEGG富集分析） （*）基因结构分析（做成勾选项目）：新转录本位点分析、UTR分析、AS分析、SNP与INDEL分析 备注：需添加转录组子绘图功能 *.*.*细菌/病毒基因组平台搭建的内容 组装出单物种的基因序列：基因组组装、序列比对、变异位点检测（突变位点、氨基酸的情况以及整体的突变频率图） 常规的分析：基因结构注释和预测、蛋白功能注释和预测（COG聚类图、KEGG聚类图、GO聚类图）、基因组圈图 *.*.*宏基因组数据平台搭建的内容 基因预测：基因预测基本统计、基因数目韦恩图分析、组间基因数目差异分析、基因多样性分析 物种注释：物种丰度概况（门、属、KRONA分析示例图）、物种相对丰度聚类热图、PCOA分析、样本聚类分析、组间物种差异分析（LEFSE判别分析） 功能注释：功能丰度概况、功能相对丰度聚类热图、功能丰度PCOA分析、基于功能丰度的样本聚类分析、代谢通路比较分析、组间功能差异分析、功能注释分析（注释比例统计、Uniprot注释、KEGGPathway分类、Refseq注释、Pfam结构域分类、COG 分类、TIGRFAMs注释、CAZy数据库注释、ARDB数据库注释、CARD数据库注释、VFDB数据库注释、病原宿主互作分析、细胞色素 P***注释、TCDB 转运蛋白分类注、）基因丰度估计、差异基因和富集分析（基因丰度整体情况——基因表达PCA图和Pearson相关性图、基因差异分析——差异基因火山图和差异基因KEGG富集气泡图、物种丰度表——门纲目属种、α多样性、Aplha稀释曲线、ANOSIM、PCA、PCoA &permanova、差异物种分析、LEfSe多级物种差异判别分析） 备注：需添加宏基因组子绘图功能 *.*.*宏基因组医学平台搭建的内容 下机数据跟数据库进行比对，鉴定物种。 *.* 工作要求 *.*.*项目开展过程中，由投标方提供相关信息起草编写的高通量测序（NGS）分析系统方案。此类调整由投标方体现在终版方案和项目报告中并邮寄给**公司。 *.*.*中标人不得中途退标，中标通知书下达十日内，中标人必须与招标人依据招标文件的内容签订合同。否则，招标人有权另行确定中标人，并依照《中华人民**国招标投标法》进行处置，并列入**公司黑名单，三年内不得参与**公司投标。合同签订后，本招标文件自然转为合同附件，与合同具有同等法律效力。 *.*.*投标单位应在规定时间完成所有工作，各项任务的完成节点以合同形式约定为准，如遇特殊情况，经双方协商后可顺延。 *.报价方式 *.*投标人应提交已标价的报价。 报价表由以下部分组成，分别为：高通量测序（NGS）分析系统搭建的费用，报价表应包括本次招标全部内容的各项价格，并最终形成总价，如有缺项或漏项，在项目实施过程中，招标人将不予支付，并认为此项费用包含在总价中。 *.*投标人在服务期间的所有人员的交通、住宿和伙食费应含在总价中，招标人不再额外支付。 *.*投标人所报的相应分项的价格在合同实施期间应保持不变，并不因劳务、材料、机械、运输等成本的价格以及税金等其它一切因素的变动而做任何调整。 *.特别说明 承诺无故拖延项目完成一天，扣除全部报价的*.*%作为违约金,拖延一周扣除全部报价的**%作为违约金,拖延**天扣除全部报价的**%作为违约金,**天解除合同，并承担赔付责任。 *. 报名方式 *.*报名截止日期： ****年**月**日**点** *.*报名资质：投标人需准备公司营业执照（复印件加盖公章）、资质证书（复印件加盖公章）、相关业绩、法人委托书、代理人身份证。只接受网络邮箱报名，发邮件时在正文中填写清楚参与报名单位名称、报名事项及编号，联系人及联系方式。 *.*此项目评标标准是以低价优先原则做为商务部分评选基础，通过评委综合评选后确定中标推荐人。 *.*投标书需准备*份，一正二副，标书里需附有企业相关资质、业绩、报价和技术方案等资料，所有投标方制作标书中必须加入反商业贿赂承诺书。否则视为无效标书。（反商业贿赂承诺书在我公司官网首页右下角可下载） *.*报名截止日期： ****年**月**日**点** *.*报名资质：投标人需准备公司营业执照（复印件加盖公章）、资质证书（复印件加盖公章）、相关业绩、法人委托书、代理人身份证。只接受网络邮箱报名，发邮件时在正文中填写清楚参与报名单位名称、报名事项及编号，联系人及联系方式。 *.*此项目评标标准是以低价优先原则做为商务部分评选基础，通过评委综合评选后确定中标推荐人。 *.*投标书需准备*份，一正二副，标书里需附有企业相关资质、业绩、报价和技术方案等资料，所有投标方制作标书中必须加入反商业贿赂承诺书。否则视为无效标书。（反商业贿赂承诺书在我公司官网首页右下角可下载） **发布人：**生物制品研究所有限责任公司 **.*联系地址：******黄金工业园路*号**生物制品研究所有限责任 **.*联系人：汪 洋 联系电话：***-******** 报名邮箱：***********