环境样本核酸多组学分析采购公告

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【采购公告】 环境样本核酸多组学分析 报名开始时间 ****-**-** **:**:** 报名结束时间 ****-**-** **:**:** 项目信息 项目编号： ****************** 项目名称： 环境样本核酸多组学分析 采购方式： 公开询价 邀请询价 竞争性谈判 竞争性磋商 单一来源采购 项目比选 商品比选 评审办法： 有效最低价 综合评估法 项目类型： 技术服务 预算金额 采购人信息 采购单位: 联系人: 电话: 地址: 邮箱: 商品信息 序号 商品信息 数量 计量单位 预算单价 预算总额 商品参数 商品备注 * 环境样本核酸多组学分析 品牌：无 货号/型号：无 规格：项 查看偏离表 * 项 *、数据质控： （*）测序原始数据进行质量检测，Q**>**%； （*）切除接头、低质量碱基并过滤低质量序列，确认序列质量已达到分析标准； （*）原始测序数据质量统计结果，包括插入片段长度、测序reads数目、测序碱基数目、GC含量、Q**（Phred值大于 ** 的碱基数占总碱基数的百分比）、Q**（Phred 值大于 ** 的碱基数占总碱基数的百分比）等； *、物种注释： 序列比对到标记基因数据库，获得微生物（包括细菌、古菌、真核生物和病毒）群落组成，至少包含以下分析： （*）物种相对丰度概况； （*）注释基因数目及物种相对丰度聚类分析； （*）物种相对丰度降维分析； （*）基于 Bray-Curtis 距离的物种相对丰度降维分析； （*）物种相对丰度 Anosim 分析； （*）基于物种丰度 Bray-Curtis 距离的样本聚类分析； （*）组间差异物种 Wilcoxon 分析； （*）组间差异物种 LEfSe 分析； （*）物种相对丰度随机森林分析； *、基因及功能注释： 构建泛基因组数据库，序列比对到泛基因组数据库，获得所有已知物种的基因注释信息；将未比对到泛基因组上的序列翻译后比对到蛋白数据库获得未知物种的基因注释信息。至少包含以下分析： （*）注释基因数目统计； （*）抗性基因分析； （*）功能相对丰度统计； （*）功能相对丰度聚类分析； （*）功能相对丰度降维分析； （*）基于 Bray-Curtis 距离的功能相对丰度降维分析； （*）功能相对丰度 Anosim 分析； （*）基于功能丰度 Bray-Curtis 距离的样本聚类分析； （*）KEGG 代谢通路比较分析； （**）组间差异功能 Wilcoxon 分析； （**）组间差异功能 LEfSe 分析； （**）功能相对丰度随机森林分析； *、可视化分析： 根据各样本基因、物种丰度及功能丰度表，在样本数大于或等于 * 个时，至少进行 PCA、NMDS、PCoA 等降维分析，样本聚类分析。 内容公告 *、数据质控： （*）测序原始数据进行质量检测，Q**>**%； （*）切除接头、低质量碱基并过滤低质量序列，确认序列质量已达到分析标准； （*）原始测序数据质量统计结果，包括插入片段长度、测序reads数目、测序碱基数目、GC含量、Q**（Phred值大于 ** 的碱基数占总碱基数的百分比）、Q**（Phred 值大于 ** 的碱基数占总碱基数的百分比）等； *、物种注释： 序列比对到标记基因数据库，获得微生物（包括细菌、古菌、真核生物和病毒）群落组成，至少包含以下分析： （*）物种相对丰度概况； （*）注释基因数目及物种相对丰度聚类分析； （*）物种相对丰度降维分析； （*）基于 Bray-Curtis 距离的物种相对丰度降维分析； （*）物种相对丰度 Anosim 分析； （*）基于物种丰度 Bray-Curtis 距离的样本聚类分析； （*）组间差异物种 Wilcoxon 分析； （*）组间差异物种 LEfSe 分析； （*）物种相对丰度随机森林分析； *、基因及功能注释： 构建泛基因组数据库，序列比对到泛基因组数据库，获得所有已知物种的基因注释信息；将未比对到泛基因组上的序列翻译后比对到蛋白数据库获得未知物种的基因注释信息。至少包含以下分析： （*）注释基因数目统计； （*）抗性基因分析； （*）功能相对丰度统计； （*）功能相对丰度聚类分析； （*）功能相对丰度降维分析； （*）基于 Bray-Curtis 距离的功能相对丰度降维分析； （*）功能相对丰度 Anosim 分析； （*）基于功能丰度 Bray-Curtis 距离的样本聚类分析； （*）KEGG 代谢通路比较分析； （**）组间差异功能 Wilcoxon 分析； （**）组间差异功能 LEfSe 分析； （**）功能相对丰度随机森林分析； *、可视化分析： 根据各样本基因、物种丰度及功能丰度表，在样本数大于或等于 * 个时，至少进行 PCA、NMDS、PCoA 等降维分析，样本聚类分析。 附件信息 附件：配置需求表-环境样本核酸多组学分析-casmart.docx 采购单位:**某科研中心 报名网址：https://bidweb.casmart.com.cn/#/frontStation/purchaseDetailid=*****&keys=*