玫瑰茄全基因组图谱开发(EJWJ2024157)延期公告
正文内容
项目名称 玫瑰茄全基因组图谱开发 项目编号 EJWJ******* 公告开始日期 ****-**-** **:**:** 公告截止日期 ****-**-** **:**:** 采购单位 ****** 付款方式 待结题报告交付后,付全款。 联系人 登录后可见 联系电话 登录后可见 签约时间要求 成交后**日内 到货时间要求 预算总价 ¥ *****.** 发票要求 增值税普通发票 增值税专用发票 含税要求 送货要求 安装要求 收货地址 供应商资质要求 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 公告说明 由于该项目报价供应商数量不满足要求,本项目延期至****-**-** **:** 采购清单* 采购商品 采购数量 计量单位 所属分类 玫瑰茄全基因组图谱开发 * 项 农学研究服务 无 无 品牌 品牌* 型号 品牌* 型号 品牌* 型号 品牌* 型号 品牌* 型号 品牌* 型号 预算单价 ¥*****.** 技术参数及配置要求 *、完成玫瑰茄样品的DNA提取,质检合格后构建三代测序基因组文库进行PacBio Revio测序技术平台HIFI测序模式测序并进行数据质控,测序数据量**Gb;构建二代测序基因组文库进行DNB-SEQ测序平台PE***测序策略测序并进行数据质控,测序数据量**G; *、完成玫瑰茄样品的甲醛交联、细胞核提取,构建*个Hi-C文库,质检后基于illumina测序平台进行测序。测序数据量***Gb; *、完成*个玫瑰茄不同组织样品的RNA提取,质检合格后进行基于DNB-SEQ平台进行常规转录组测序,测序数据量*G;取不同组织部位玫瑰茄样品进行RNA提取,质检合格后基于Nanopore平台进行转录组测序,测序数据量**G; 完成测序后进行HIFI单倍型基因组图谱分析,分析内容如下:(*)数据质控;(*)单倍型基因组组装(共组装*套)(组装、组装结果评估);(*)HIC辅助基因组拼接,比对参考基因组,将组装得到的Contig挂载到染色体,挂载率>**%;(*)基因组注释基因组注释(重复序列注释、基因结构注释、基因功能注释、ncRNA注释);(*)比较基因组学分析(基因家族分析、系统进化分析);(*)单倍型基因组特有分析、亚基因组结构变异分析、亚基因组不对称进化分析(Ka/Ks差异分析)等位基因表达偏岐分析; *、*)供应商样本提取合格率≥**%,对于DNA提取不合格样本,提取到合格为止。 *)供应商针对检测合格后的样品(样本总量≥ ***ng),搭配自动化建库仪器,通量做到*人/*H/**个样本。 *)供应商拥有自主nanopore测序仪并服务过使用Nanopore平台测序的用户,并发表过文章。 参考链接 售后服务 *×**小时技术支持,服务响应时限:反馈问题后*小时内; ****-**-** **:**:** 报名地址:https://app.yuncaitong.cn/login.html
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