水稻种质资源DNA分子指纹图谱库构建（合同包2）结果公告

正文内容

一、项目编号：GZGK**P***C****Z 二、项目名称：水稻种质**DNA分子指纹图谱库构建 三、采购结果 合同包*(稻属种质**基因组测试服务): 供应商名称 供应商地址 中标（成交）金额 **链康医学检验实验室有限公司 **省**经济技术开发区白杨街道*号大街***号*幢*楼西 ***,***.**元 四、主要标的信息 合同包*(稻属种质**基因组测试服务): 服务类（**链康医学检验实验室有限公司） 品目号 品目名称 采购标的 服务范围 服务要求 服务时间 服务标准 *-* 其他自然科学研究和试验开发服务 稻属种质**基因组测定 完成野生稻种质**基因组重测序 *、样本运送和提取质检 （*）送检样品为水稻组织，需供应商需上门取样，采用干冰运输。 （*）DNA提取：基于磁珠吸附法对样本进行DNA提取，并进行DNA浓度检测，样品DNA总量不低于*μg，核酸浓度≧**ng/μL。 （*）DNA质检：通过琼脂糖凝胶电泳成像系统评估DNA质量，要求条带清晰，无RNA/蛋白污染，筛选符合试验要求的高质量DNA，用于后续建库测序，并进行文库质检保证文库质量。 *、数据测序和质控 （*）测序平台：采用高通量二代或三代测序平台开展测序； ▲（*）平均每个个体数据量达到** Gb cleandata； ▲（*）质控后所有序列的每个碱基的质量值（-**log**(error P)，其中P为Phred质量评分）大于**；质控后重复序列在所有序列中占比不超过**%；质控后基因组比对率≥**% 合同签订之日起 ** 天内完成 严格按照招标文件中的各项要求执行 *-* 其他自然科学研究和试验开发服务 基因组遗传多样性以及泛基因组分析 完成基因组遗传多样性以及泛基因组分析 *、数据分析和交付 （*）原始数据质控和比对分析：测序质量原始统计、比对参考基因组统计（含覆盖度、dup%、比对率等）、样本的全基因组覆盖深度阶梯图、染色体的平均覆盖深度等。 （*）变异检测分析（包括SNP，InDel，SV和CNV）：SNP/InDel原始突变注释信息（VCF格式）、SNP和InDel所在位置分类及注释信息、全基因组SNP/InDel变异位点密度分布、结构变异SV检测（VCF格式）和注释、拷贝数变异（CNV）检测和注释等。 （*）GWAS分析：系统发育树、群体结构分析、主成分分析、亲缘关系分析、性状关联分析、单倍型分析等。 （*）泛基因组分析：核心基因组、可变基因组、泛基因组曲线分析、泛基因组可视化和比较基因组学分析 合同签订之日起 ** 天内完成 严格按照招标文件中的各项要求执行 五、评审专家（单一来源采购人员）名单： 张威、李春生、王代容、巫光宏、李晨（采购人代表） 六、代理服务收费标准及金额： 代理服务收费标准 本项目的招标代理服务费收费标准以各采购包的采购预算金额为计算基数根据招标代理机构官网（http://www.gzgkbidding.com/index.phpm=Home&c=News&a=detail&id=**）规定的收费标准按服务采购类型进行计算收取，计算后不足****元按****元收取。 合同包号 合同包名称 代理服务费金额（万元） 收取对象 * 稻属种质**基因组测试服务 *.* 中标（成交）供应商 七、公告期限 自本公告发布之日起*个工作日。 八、其他补充事宜 合同包*(稻属种质**基因组测试服务): 供应商 资格性审查 符合性审查 技术得分 商务得分 价格得分 综合得分 得分排名 推荐排名 **链康医学检验实验室有限公司 通过 通过 **.** **.** **.** **.** * * **泰优安华生物技术有限公司 通过 通过 **.** **.** *.** **.** * * **基迪奥生物科技有限公司 通过 通过 **.** *.** *.** **.** * **美格基因科技有限公司 通过 通过 **.** *.** *.** **.** * 九、凡对本次公告内容提出询问，请按以下方式联系。 *.采购人信息 名称：**省农业科学院水稻研究所 地址：******金颖东一街*号 联系方式：***-******** *.采购代理机构信息 名称：************* 地址：***先烈中路***号科学院大院*号楼东座*楼（中国**分析测试中心对面） 联系方式：***-********、***-******** *.项目联系方式 项目联系人：谢学超、吴秋娜 电话：***-********、***-******** ************* ****年**月**日 相关附件： 合同包*：中小企业或残疾人福利单位声明函（**链康医学检验实验室有限公司）.pdf 合同包*：报价明细附件（**链康医学检验实验室有限公司）.pdf 信息地址:https://gdgpo.czt.gd.gov.cn/freecms/site/gd/ggxx/info/****/*a*ee*d***f*fb*e****fca**f****ed.htmlnoticeType=******